契税发票上计税金额与购房总价有差异可能正常，需具体核实。根据税法，契税计税依据可能因税率及税收政策调整而异。《中华人民共和国契税暂行条例》规定，契税计税依据为房屋成交价格。若存在差异且未及时核实处理，可能导致多缴或少缴契税，影响您的合法权益。
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处理契税发票计税金额问题，常见方式有咨询税务部门或开发商。建议先核对购房合同与契税发票，若仍有疑问，可咨询当地税务部门或开发商，以获取最准确的解释和处理建议。
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契税发票金额需核实。具体操作：1.核对购房合同与契税发票金额是否一致；2.若不一致，先与开发商沟通了解原因；3.如开发商无法解释，联系当地税务部门咨询，了解是否需要调整契税金额；4.根据税务部门建议，及时补缴或申请退税，确保合法权益。