基本农田种植的苗木需依法处理。首先，应确保有生产用地证明和资金证明。其次，依据相关法规，苗木生产需具备林木种子检验人员及技术人员的资格证明，否则可能面临非法经营的后果。《种子法》、《森林法》等对此有明确规定，缺乏相应证明可能导致苗木无法合法销售或面临处罚。
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处理苗木问题需分情况：1. 面积300亩以下，需1名种子检验员和1-2名技术员；2. 面积300亩及以上，需2名种子检验员和3名以上技术员；3. 所有技术人员均需经市林业局培训合格，以确保苗木生产的合法性和质量。同时，应办理好生产用地和资金证明，避免非法经营风险。
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处理基本农田种植的苗木，常见方式包括：办理合法手续、规范生产管理、确保技术人员资质。您应先获取生产用地和资金证明，再根据苗圃面积，确保有相应数量的经培训合格的种子检验人员和技术员。《种子法》要求，不同面积的苗圃需配备不同数量的专业人员，以确保苗木生产的合法性和规范性。