员工有重大疾病，不可以辞退。员工重病病假期间，若医疗期内被辞退，用人单位属违法解除，需支付赔偿金和医疗补助金。依据《劳动合同法》，劳动者医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。
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员工重大疾病处理：
1. 医疗期内，用人单位需保留劳动关系，并按规定支付病假工资。
2. 医疗期满，如员工仍不能工作，可合法解除劳动合同，但需支付经济补偿金和医疗补助金。
3. 若未支付相应补偿，员工可申请劳动仲裁，维护自身权益。
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员工重大疾病，常见处理方式为：医疗期内保留劳动关系，支付病假工资；医疗期满，可合法解除但需支付经济补偿金和医疗补助金。选择时，应考量员工医疗期是否已满及法律规定。