在邻居拒绝协商的情况下，您不能直接采取行动清理排水沟。虽然排水沟被堵塞可能给您带来不便，但直接采取行动可能会引发更大的纠纷。根据《民法典》的相关规定，您应先尝试通过协商或调解解决争议。如果协商和调解均无果，您可以考虑到当地人民法院起诉，通过法律途径来维护自己的权益。在此过程中，请确保您的行为合法，避免激化矛盾。
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除了起诉外，您还可以尝试以下途径解决排水沟被堵塞的问题：1. 与邻居再次友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。2. 请村委会或当地人民调解委员会进行调解，他们可能会提供中立的意见和帮助。3. 考虑寻求政府相关部门的协助，如水利部门或城乡规划部门，他们可能对排水设施的管理和维护有相应的职责。
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从法律角度，您可以采取以下措施确保自己的权益不受侵害：1. 保留证据：拍照或录像记录排水沟被堵塞的情况，以及因此给您生活带来的不便。2. 咨询律师：在采取任何行动前，咨询专业律师，了解您的法律权益和可能的法律后果。3. 依法维权：通过协商、调解或起诉等合法途径，维护自己的合法权益，避免采取过激行为。